Coligny fu una delle prime vittime di Santo-Barthélemy: il tedesco Besme entrò nella sua camera con una banda di autoadesivi: "È -ce bene tu l'ammiraglio ?" "-" è io, rispose Coligny senza disturbarsi, fa ciò che vorrai; è da molto tempo che sono pronto a morire. "Besme gli immerse la sua spada nel petto blasphémant." "Besme, gridava il duca di modo, che era restato nella via, Besme, è finito ?" "-" è fatto. "rispose l'assassino." - "Getta con la finestra che lo ho visto." "Besme obbedisce, e modo ebbe il infamie di insultare il suo nemico morto, e colpirlo da un calcio al viso."

Charles IX, dopo avere a lungo resistito alle eccitazioni della sua madre, aveva finito per lui cedere: "Con la morte dio, dice -il con collera, poiché trovate bene che si uccide l'ammiraglio, io vogliono, io, che si uccidono anche tutti i huguenots della Francia, perché ne non resti uno che possa rimproverarmelo." "Catherine non trascurò nulla perché questo desiderio fosse interamente soddisfatto."

Catherine de Médicis passò tutta la sera del sabato 23 ed una parte della notte da preparare il crimine con Henri di modo ed i suoi altri complici: si distribuirono i ruoli, si fecero chiudere le porte di Parigi, e collegare tutte le barche della Seine, quindi gli autoadesivi si resero con piccole truppe ai posti che si assegnarono loro, tanto che a due ore della mattina, al segnale dato dalla campana di santo-Germano Auxerrois, il massacro cominciò ovunque allo stesso tempo: i protestanti, sorpresi per la maggior parte nel loro letto, non poterono neppure difendersi; gli assassini non si accontentarono di massacrare Coligny e gli altri capi della parte protestante: nobili, magistrati, borghesi, artigiani, tutti coloro che si poterono prendere perirono, uccisi a colpo di pistola o a colpo di spada, colpiti, strangolati, annegati, sventrati, i boie non salvarono né le donne, né i bambini: "Purgate, purgate, gridavate ricanant uno dei principali esecutori, l'intaglio è così buona in agosto che in maggio." "Populace, messa in gioia, trascinava i cadaveri di via in via, i selciati erano rossi ed il sangue colava nei ruscelli." Alcune centinaia di protestanti che abitavano nel sobborgo Santo-germano, al di fuori delle pareti, si riunirono al rumore degli arquebusades, e che si immaginano che fosse una sommossa dei modi contro il re, si diresse verso il Tuileries per difenderlo, ma quando arrivarono sul marciapiede, furono accolti da colpi di fuoco, ed il re stesso prese arquebuse per trarre su loro: rebroussèrent cammino in qualsiasi rapidita, ed il duca di modo, che si era proteso alla loro prosecuzione, non poté riuscire a raggiungerli (24 agosto 1572).

I massacri di Parigi si ripeterono in provincia, a Lione, a Bordeaux, a Rouen, a Meaux, a Troyes, a Bourges, alla carita, a Tours, ad Orlèans, ad Saumur, ad Angers, ecc..

Loire Garonne ed il Rodano rotolarono, come Seine, delle centinaia di cadaveri.

Si può ritenere che Santo-Barthélemy faccia circa 20.000 vittime, di cui 2000 almeno a Parigi e 500 a Rouen.

Il re restò alcuni tempi immerso nell'intossicazione del suo crimine, ma quando ritornò alla ragione, ebbe vergogna di sé stesso, perse il riposo, e le sue notti furono disturbate da incubi terribili: intendeva grida, vedeva mucchi di cadaveri, e come sentiva la morte avvicinarsi, tremava di spavento, respingeva il suo crimine sulla sua madre, ed implorava sanglotant la misericordia di dio.

La sua fine fu così misera che i protestanti stessi ne testimoniarono qualche pitié.

Morì il 30 maggio 1574: non aveva ancora ventiquattro anni.